Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HACE1Q8IYU2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms