Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL24A1Q17RW2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
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