Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN7P41732 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSPAN7P41732 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms