Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME1P15531 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME1P15531 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME1P15531 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME1P15531 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME1P15531 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME1P15531 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME1P15531 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME1P15531 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME1P15531 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NME1P15531 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms