Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP19O94966 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP19O94966 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP19O94966 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP19O94966 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP19O94966 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP19O94966 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP19O94966 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP19O94966 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP19O94966 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP19O94966 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP19O94966 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP19O94966 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP19O94966 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP19O94966 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP19O94966 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP19O94966 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
USP19O94966 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP19O94966 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP19O94966 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
USP19O94966 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP19O94966 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP19O94966 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP19O94966 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP19O94966 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP19O94966 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP19O94966 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP19O94966 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP19O94966 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP19O94966 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP19O94966 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP19O94966 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP19O94966 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP19O94966 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP19O94966 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP19O94966 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
USP19O94966 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP19O94966 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP19O94966 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP19O94966 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP19O94966 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP19O94966 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP19O94966 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP19O94966 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP19O94966 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP19O94966 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP19O94966 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP19O94966 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP19O94966 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms