Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYD88Q99836 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYD88Q99836 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms