Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGBD1Q96JS3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGBD1Q96JS3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGBD1Q96JS3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms