Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SIRT1Q96EB6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIRT1Q96EB6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms