Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 SFSWAP-209ENST00000540469 3536 ntTSL 312.86□□□□□ -0.355e-13■■■■■ 44
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SF3B4Q15427 SIRT1-206ENST00000497639 673 ntTSL 58.7□□□□□ -1.025e-13■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.285e-13■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.455e-13■■■■■ 44
SF3B4Q15427 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 54.77□□□□□ -1.655e-13■■■■■ 44
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SF3B4Q15427 GDI1-209ENST00000475976 600 ntTSL 213.97□□□□□ -0.172e-14■■■■■ 44
SF3B4Q15427 GDI1-203ENST00000445564 568 ntTSL 413.97□□□□□ -0.172e-14■■■■■ 44
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SF3B4Q15427 WBP2-218ENST00000593002 610 ntTSL 49.99□□□□□ -0.815e-14■■■■■ 44
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SF3B4Q15427 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 216.85■□□□□ 0.295e-13■■■■■ 43.9
SF3B4Q15427 CAD-206ENST00000464159 589 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 43.8
SF3B4Q15427 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 43.8
SF3B4Q15427 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.279e-9■■■■■ 43.8
SF3B4Q15427 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 43.8
SF3B4Q15427 USP19-204ENST00000398896 3907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.649e-9■■■■■ 43.8
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SF3B4Q15427 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 43.8
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SF3B4Q15427 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 43.8
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SF3B4Q15427 PRPF40B-214ENST00000551320 455 ntTSL 26.11□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 43.8
SF3B4Q15427 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 43.8
SF3B4Q15427 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 43.7
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SF3B4Q15427 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 43.7
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SF3B4Q15427 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 316.27■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 43.6
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SF3B4Q15427 AGTRAP-208ENST00000476309 748 ntTSL 313.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 43.6
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SF3B4Q15427 AGTRAP-213ENST00000513739 566 ntTSL 311.1□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 43.6
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SF3B4Q15427 CCNL2-214ENST00000482365 2620 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 CCNL2-204ENST00000418865 3082 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 SF3A3-203ENST00000461869 776 ntTSL 313.97□□□□□ -0.171e-12■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-12■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 SF3A3-204ENST00000462258 527 ntTSL 29.25□□□□□ -0.931e-12■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 SF3A3-205ENST00000470585 704 ntTSL 36.35□□□□□ -1.391e-12■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 SF3A3-208ENST00000489537 891 ntTSL 45.68□□□□□ -1.51e-12■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 GPT2-204ENST00000562801 2092 ntTSL 213.22□□□□□ -0.294e-9■■■■■ 43.6
SF3B4Q15427 ARHGEF1-214ENST00000596957 570 ntTSL 313.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 CHD1L-206ENST00000469625 423 ntTSL 55.46□□□□□ -1.542e-11■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 CHD1L-207ENST00000485113 377 ntTSL 35□□□□□ -1.612e-11■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 FGG-206ENST00000443553 789 ntTSL 55.3□□□□□ -1.564e-17■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 FGG-202ENST00000393846 641 ntTSL 24.47□□□□□ -1.694e-17■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 SATB2-204ENST00000440919 2166 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.277e-10■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.117e-10■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.057e-10■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.17e-10■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.357e-10■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.367e-10■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 SATB2-207ENST00000463386 372 ntTSL 49.99□□□□□ -0.817e-10■■■■■ 43.5
SF3B4Q15427 PITPNB-210ENST00000493007 564 ntTSL 38.21□□□□□ -1.14e-9■■■■■ 43.5
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