RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.31■■■■■ 4.84
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TSPAN4-216ENST00000526055 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.22■■■■□ 3.71
TSPAN4-216ENST00000526055 NACADO15069 1562 aa38.13■■■■□ 3.69
TSPAN4-216ENST00000526055 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.9■■■■□ 3.66
TSPAN4-216ENST00000526055 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.87■■■■□ 3.65
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TSPAN4-216ENST00000526055 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.56■■■■□ 3.6
TSPAN4-216ENST00000526055 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.22■■■■□ 3.55
TSPAN4-216ENST00000526055 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.12■■■■□ 3.53
TSPAN4-216ENST00000526055 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.01■■■■□ 3.52
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TSPAN4-216ENST00000526055 SCRIBQ14160 1630 aa36.77■■■■□ 3.48
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
TSPAN4-216ENST00000526055 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36■■■■□ 3.35
TSPAN4-216ENST00000526055 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.84■■■■□ 3.33
TSPAN4-216ENST00000526055 NCAPD3P42695 1498 aa35.19■■■■□ 3.22
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TSPAN4-216ENST00000526055 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.12■■■■□ 3.21
TSPAN4-216ENST00000526055 SMARCA2P51531 1590 aa35.09■■■■□ 3.21
TSPAN4-216ENST00000526055 HMGXB3Q12766 1538 aa34.97■■■■□ 3.19
TSPAN4-216ENST00000526055 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.92■■■■□ 3.18
TSPAN4-216ENST00000526055 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.87■■■■□ 3.17
TSPAN4-216ENST00000526055 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
TSPAN4-216ENST00000526055 WIZO95785 1651 aa34.43■■■■□ 3.1
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TSPAN4-216ENST00000526055 NESP48681 1621 aa34.32■■■■□ 3.08
TSPAN4-216ENST00000526055 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.29■■■■□ 3.08
TSPAN4-216ENST00000526055 CUX2O14529 1486 aa34.2■■■■□ 3.06
TSPAN4-216ENST00000526055 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.14■■■■□ 3.06
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TSPAN4-216ENST00000526055 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.89■■■■□ 3.02
TSPAN4-216ENST00000526055 CFTRP13569 1480 aa33.87■■■■□ 3.01
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TSPAN4-216ENST00000526055 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.71■■■□□ 2.99
TSPAN4-216ENST00000526055 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.71■■■□□ 2.99
TSPAN4-216ENST00000526055 WDR62O43379 1518 aa33.63■■■□□ 2.97
TSPAN4-216ENST00000526055 PRDM2Q13029 1718 aa33.5■■■□□ 2.95
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TSPAN4-216ENST00000526055 ABCC8Q09428 1581 aa33.2■■■□□ 2.91
TSPAN4-216ENST00000526055 TOPBP1Q92547 1522 aa33.12■■■□□ 2.89
TSPAN4-216ENST00000526055 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.07■■■□□ 2.88
TSPAN4-216ENST00000526055 IFT140Q96RY7 1462 aa33.05■■■□□ 2.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 SOGA1O94964 1423 aa32.7■■■□□ 2.83
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
TSPAN4-216ENST00000526055 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.68■■■□□ 2.82
TSPAN4-216ENST00000526055 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.64■■■□□ 2.82
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TSPAN4-216ENST00000526055 WDR97A6NE52 1622 aa32.6■■■□□ 2.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
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TSPAN4-216ENST00000526055 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.41■■■□□ 2.78
TSPAN4-216ENST00000526055 TOP2BQ02880 1626 aa32.4■■■□□ 2.78
TSPAN4-216ENST00000526055 GRIN2BQ13224 1484 aa32.38■■■□□ 2.77
TSPAN4-216ENST00000526055 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM41Q8WV44 630 aa32.36■■■□□ 2.77
TSPAN4-216ENST00000526055 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
TSPAN4-216ENST00000526055 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.33■■■□□ 2.77
TSPAN4-216ENST00000526055 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.31■■■□□ 2.76
TSPAN4-216ENST00000526055 SYNJ1O43426 1573 aa32.31■■■□□ 2.76
TSPAN4-216ENST00000526055 CHD1O14646 1710 aa32.3■■■□□ 2.76
TSPAN4-216ENST00000526055 FBLN2P98095 1184 aa32.29■■■□□ 2.76
TSPAN4-216ENST00000526055 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.26■■■□□ 2.75
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TSPAN4-216ENST00000526055 SYNJ2O15056 1496 aa32.2■■■□□ 2.75
TSPAN4-216ENST00000526055 PBRM1Q86U86 1689 aa32.19■■■□□ 2.74
TSPAN4-216ENST00000526055 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.15■■■□□ 2.74
TSPAN4-216ENST00000526055 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.15■■■□□ 2.74
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TSPAN4-216ENST00000526055 CEP170Q5SW79 1584 aa31.74■■■□□ 2.67
TSPAN4-216ENST00000526055 IGF1RP08069 1367 aa31.72■■■□□ 2.67
TSPAN4-216ENST00000526055 CUL7Q14999 1698 aa31.64■■■□□ 2.65
TSPAN4-216ENST00000526055 SHROOM2Q13796 1616 aa31.6■■■□□ 2.65
TSPAN4-216ENST00000526055 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.53■■■□□ 2.64
TSPAN4-216ENST00000526055 JPH4Q96JJ6 628 aa31.51■■■□□ 2.63
TSPAN4-216ENST00000526055 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.49■■■□□ 2.63
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