Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms