Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMB2P55268 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMB2P55268 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms