Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFRP42898 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms