Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL3P36405 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL3P36405 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL3P36405 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL3P36405 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARL3P36405 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms