Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD10P28358 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD10P28358 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms