Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1P21675 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TAF1P21675 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
TAF1P21675 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1P21675 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1P21675 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1P21675 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1P21675 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1P21675 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1P21675 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1P21675 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF1P21675 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF1P21675 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF1P21675 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF1P21675 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF1P21675 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1P21675 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1P21675 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1P21675 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1P21675 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1P21675 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms