Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP3P08254 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP3P08254 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP3P08254 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP3P08254 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP3P08254 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP3P08254 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP3P08254 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP3P08254 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP3P08254 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP3P08254 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP3P08254 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP3P08254 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP3P08254 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP3P08254 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP3P08254 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms