Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXC11O43248 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC11O43248 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC11O43248 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms