Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXND1Q9Y4D7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXND1Q9Y4D7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXND1Q9Y4D7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXND1Q9Y4D7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXND1Q9Y4D7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXND1Q9Y4D7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLXND1Q9Y4D7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXND1Q9Y4D7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXND1Q9Y4D7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXND1Q9Y4D7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXND1Q9Y4D7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLXND1Q9Y4D7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXND1Q9Y4D7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXND1Q9Y4D7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXND1Q9Y4D7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXND1Q9Y4D7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXND1Q9Y4D7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXND1Q9Y4D7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXND1Q9Y4D7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXND1Q9Y4D7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXND1Q9Y4D7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXND1Q9Y4D7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXND1Q9Y4D7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXND1Q9Y4D7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXND1Q9Y4D7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXND1Q9Y4D7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXND1Q9Y4D7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXND1Q9Y4D7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PLXND1Q9Y4D7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXND1Q9Y4D7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXND1Q9Y4D7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PLXND1Q9Y4D7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXND1Q9Y4D7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXND1Q9Y4D7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXND1Q9Y4D7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXND1Q9Y4D7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXND1Q9Y4D7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PLXND1Q9Y4D7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXND1Q9Y4D7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms