Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSX2IPQ9Y2D8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SSX2IPQ9Y2D8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SSX2IPQ9Y2D8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SSX2IPQ9Y2D8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSX2IPQ9Y2D8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SSX2IPQ9Y2D8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SSX2IPQ9Y2D8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSX2IPQ9Y2D8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SSX2IPQ9Y2D8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSX2IPQ9Y2D8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSX2IPQ9Y2D8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SSX2IPQ9Y2D8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SSX2IPQ9Y2D8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SSX2IPQ9Y2D8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSX2IPQ9Y2D8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SSX2IPQ9Y2D8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SSX2IPQ9Y2D8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SSX2IPQ9Y2D8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SSX2IPQ9Y2D8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSX2IPQ9Y2D8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SSX2IPQ9Y2D8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSX2IPQ9Y2D8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSX2IPQ9Y2D8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSX2IPQ9Y2D8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSX2IPQ9Y2D8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSX2IPQ9Y2D8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSX2IPQ9Y2D8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSX2IPQ9Y2D8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSX2IPQ9Y2D8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSX2IPQ9Y2D8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSX2IPQ9Y2D8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSX2IPQ9Y2D8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSX2IPQ9Y2D8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSX2IPQ9Y2D8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SSX2IPQ9Y2D8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSX2IPQ9Y2D8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSX2IPQ9Y2D8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSX2IPQ9Y2D8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSX2IPQ9Y2D8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SSX2IPQ9Y2D8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSX2IPQ9Y2D8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SSX2IPQ9Y2D8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SSX2IPQ9Y2D8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SSX2IPQ9Y2D8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSX2IPQ9Y2D8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSX2IPQ9Y2D8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSX2IPQ9Y2D8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SSX2IPQ9Y2D8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSX2IPQ9Y2D8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSX2IPQ9Y2D8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms