Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX6Q9UPM6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX6Q9UPM6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX6Q9UPM6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX6Q9UPM6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX6Q9UPM6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX6Q9UPM6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX6Q9UPM6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX6Q9UPM6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX6Q9UPM6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX6Q9UPM6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX6Q9UPM6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX6Q9UPM6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX6Q9UPM6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX6Q9UPM6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX6Q9UPM6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX6Q9UPM6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX6Q9UPM6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX6Q9UPM6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX6Q9UPM6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX6Q9UPM6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX6Q9UPM6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX6Q9UPM6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX6Q9UPM6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX6Q9UPM6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX6Q9UPM6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX6Q9UPM6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX6Q9UPM6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX6Q9UPM6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX6Q9UPM6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX6Q9UPM6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX6Q9UPM6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX6Q9UPM6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX6Q9UPM6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX6Q9UPM6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX6Q9UPM6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX6Q9UPM6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX6Q9UPM6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX6Q9UPM6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX6Q9UPM6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX6Q9UPM6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX6Q9UPM6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX6Q9UPM6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LHX6Q9UPM6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX6Q9UPM6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX6Q9UPM6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX6Q9UPM6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX6Q9UPM6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LHX6Q9UPM6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX6Q9UPM6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX6Q9UPM6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX6Q9UPM6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LHX6Q9UPM6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LHX6Q9UPM6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LHX6Q9UPM6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LHX6Q9UPM6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LHX6Q9UPM6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LHX6Q9UPM6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX6Q9UPM6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX6Q9UPM6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHX6Q9UPM6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX6Q9UPM6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHX6Q9UPM6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHX6Q9UPM6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LHX6Q9UPM6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms