Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PNMA2Q9UL42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PNMA2Q9UL42 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PNMA2Q9UL42 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PNMA2Q9UL42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PNMA2Q9UL42 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PNMA2Q9UL42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PNMA2Q9UL42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PNMA2Q9UL42 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PNMA2Q9UL42 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PNMA2Q9UL42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PNMA2Q9UL42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PNMA2Q9UL42 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PNMA2Q9UL42 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PNMA2Q9UL42 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PNMA2Q9UL42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PNMA2Q9UL42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PNMA2Q9UL42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PNMA2Q9UL42 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PNMA2Q9UL42 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PNMA2Q9UL42 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PNMA2Q9UL42 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PNMA2Q9UL42 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PNMA2Q9UL42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PNMA2Q9UL42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PNMA2Q9UL42 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PNMA2Q9UL42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PNMA2Q9UL42 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PNMA2Q9UL42 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PNMA2Q9UL42 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PNMA2Q9UL42 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PNMA2Q9UL42 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PNMA2Q9UL42 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PNMA2Q9UL42 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PNMA2Q9UL42 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PNMA2Q9UL42 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PNMA2Q9UL42 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PNMA2Q9UL42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PNMA2Q9UL42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PNMA2Q9UL42 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PNMA2Q9UL42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PNMA2Q9UL42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PNMA2Q9UL42 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PNMA2Q9UL42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PNMA2Q9UL42 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PNMA2Q9UL42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PNMA2Q9UL42 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PNMA2Q9UL42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PNMA2Q9UL42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PNMA2Q9UL42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PNMA2Q9UL42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PNMA2Q9UL42 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PNMA2Q9UL42 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PNMA2Q9UL42 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PNMA2Q9UL42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PNMA2Q9UL42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PNMA2Q9UL42 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PNMA2Q9UL42 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PNMA2Q9UL42 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PNMA2Q9UL42 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PNMA2Q9UL42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms