Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC54.29■■■■■ 6.28
BICRAQ9NZM4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC54.28■■■■■ 6.28
BICRAQ9NZM4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC54.26■■■■■ 6.28
BICRAQ9NZM4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.2■■■■■ 6.27
BICRAQ9NZM4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC54.2■■■■■ 6.27
BICRAQ9NZM4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC54.17■■■■■ 6.26
BICRAQ9NZM4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.15■■■■■ 6.26
BICRAQ9NZM4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.14■■■■■ 6.26
BICRAQ9NZM4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.14■■■■■ 6.26
BICRAQ9NZM4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC54.12■■■■■ 6.25
BICRAQ9NZM4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
BICRAQ9NZM4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC54.09■■■■■ 6.25
BICRAQ9NZM4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC54.07■■■■■ 6.25
BICRAQ9NZM4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC54■■■■■ 6.23
BICRAQ9NZM4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC53.99■■■■■ 6.23
BICRAQ9NZM4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC53.97■■■■■ 6.23
BICRAQ9NZM4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC53.97■■■■■ 6.23
BICRAQ9NZM4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC53.95■■■■■ 6.23
BICRAQ9NZM4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC53.94■■■■■ 6.23
BICRAQ9NZM4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC53.93■■■■■ 6.22
BICRAQ9NZM4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.92■■■■■ 6.22
BICRAQ9NZM4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC53.91■■■■■ 6.22
BICRAQ9NZM4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
BICRAQ9NZM4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.87■■■■■ 6.21
BICRAQ9NZM4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.87■■■■■ 6.21
BICRAQ9NZM4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC53.86■■■■■ 6.21
BICRAQ9NZM4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
BICRAQ9NZM4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC53.82■■■■■ 6.21
BICRAQ9NZM4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC53.82■■■■■ 6.21
BICRAQ9NZM4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.81■■■■■ 6.2
BICRAQ9NZM4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.79■■■■■ 6.2
BICRAQ9NZM4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC53.74■■■■■ 6.19
BICRAQ9NZM4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC53.74■■■■■ 6.19
BICRAQ9NZM4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.74■■■■■ 6.19
BICRAQ9NZM4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC53.71■■■■■ 6.19
BICRAQ9NZM4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.71■■■■■ 6.19
BICRAQ9NZM4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
BICRAQ9NZM4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
BICRAQ9NZM4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC53.61■■■■■ 6.17
BICRAQ9NZM4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC53.58■■■■■ 6.17
BICRAQ9NZM4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.57■■■■■ 6.17
BICRAQ9NZM4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
BICRAQ9NZM4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC53.56■■■■■ 6.17
BICRAQ9NZM4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.54■■■■■ 6.16
BICRAQ9NZM4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.54■■■■■ 6.16
BICRAQ9NZM4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC53.51■■■■■ 6.16
BICRAQ9NZM4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC53.51■■■■■ 6.16
BICRAQ9NZM4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
BICRAQ9NZM4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC53.5■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC53.49■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC53.47■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC53.46■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC53.46■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC53.46■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC53.45■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC53.45■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.15
BICRAQ9NZM4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
BICRAQ9NZM4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC53.42■■■■■ 6.14
BICRAQ9NZM4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
BICRAQ9NZM4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
BICRAQ9NZM4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC53.35■■■■■ 6.13
BICRAQ9NZM4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
BICRAQ9NZM4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC53.32■■■■■ 6.13
BICRAQ9NZM4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC53.31■■■■■ 6.12
BICRAQ9NZM4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC53.3■■■■■ 6.12
BICRAQ9NZM4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC53.29■■■■■ 6.12
BICRAQ9NZM4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC53.27■■■■■ 6.12
BICRAQ9NZM4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC53.27■■■■■ 6.12
BICRAQ9NZM4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
BICRAQ9NZM4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC53.25■■■■■ 6.12
BICRAQ9NZM4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.23■■■■■ 6.11
BICRAQ9NZM4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC53.23■■■■■ 6.11
BICRAQ9NZM4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC53.19■■■■■ 6.11
BICRAQ9NZM4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
BICRAQ9NZM4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.17■■■■■ 6.1
BICRAQ9NZM4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC53.14■■■■■ 6.1
BICRAQ9NZM4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.12■■■■■ 6.09
BICRAQ9NZM4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
BICRAQ9NZM4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC53.11■■■■■ 6.09
BICRAQ9NZM4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC53.1■■■■■ 6.09
BICRAQ9NZM4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC53.07■■■■■ 6.09
BICRAQ9NZM4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC53.05■■■■■ 6.08
BICRAQ9NZM4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.04■■■■■ 6.08
BICRAQ9NZM4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC53■■■■■ 6.07
BICRAQ9NZM4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.99■■■■■ 6.07
BICRAQ9NZM4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC52.98■■■■■ 6.07
BICRAQ9NZM4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC52.96■■■■■ 6.07
BICRAQ9NZM4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.95■■■■■ 6.07
BICRAQ9NZM4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC52.95■■■■■ 6.07
BICRAQ9NZM4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
BICRAQ9NZM4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC52.92■■■■■ 6.06
BICRAQ9NZM4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
BICRAQ9NZM4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
BICRAQ9NZM4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC52.88■■■■■ 6.06
BICRAQ9NZM4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC52.86■■■■■ 6.05
BICRAQ9NZM4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
BICRAQ9NZM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC52.85■■■■■ 6.05
BICRAQ9NZM4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC52.85■■■■■ 6.05
BICRAQ9NZM4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC52.82■■■■■ 6.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms