Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCTD5Q9NXV2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCTD5Q9NXV2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCTD5Q9NXV2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCTD5Q9NXV2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCTD5Q9NXV2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCTD5Q9NXV2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCTD5Q9NXV2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KCTD5Q9NXV2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCTD5Q9NXV2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCTD5Q9NXV2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCTD5Q9NXV2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCTD5Q9NXV2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCTD5Q9NXV2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCTD5Q9NXV2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCTD5Q9NXV2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCTD5Q9NXV2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCTD5Q9NXV2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCTD5Q9NXV2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCTD5Q9NXV2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCTD5Q9NXV2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCTD5Q9NXV2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCTD5Q9NXV2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCTD5Q9NXV2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCTD5Q9NXV2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCTD5Q9NXV2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCTD5Q9NXV2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCTD5Q9NXV2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCTD5Q9NXV2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCTD5Q9NXV2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCTD5Q9NXV2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms