Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD7

RXFP3, Relaxin-3 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXFP3Q9NSD7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RXFP3Q9NSD7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RXFP3Q9NSD7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXFP3Q9NSD7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXFP3Q9NSD7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RXFP3Q9NSD7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RXFP3Q9NSD7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RXFP3Q9NSD7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RXFP3Q9NSD7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXFP3Q9NSD7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RXFP3Q9NSD7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXFP3Q9NSD7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXFP3Q9NSD7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RXFP3Q9NSD7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXFP3Q9NSD7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RXFP3Q9NSD7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXFP3Q9NSD7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXFP3Q9NSD7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RXFP3Q9NSD7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RXFP3Q9NSD7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RXFP3Q9NSD7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RXFP3Q9NSD7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RXFP3Q9NSD7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RXFP3Q9NSD7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXFP3Q9NSD7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXFP3Q9NSD7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RXFP3Q9NSD7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RXFP3Q9NSD7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RXFP3Q9NSD7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RXFP3Q9NSD7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RXFP3Q9NSD7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXFP3Q9NSD7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXFP3Q9NSD7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXFP3Q9NSD7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXFP3Q9NSD7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXFP3Q9NSD7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXFP3Q9NSD7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RXFP3Q9NSD7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXFP3Q9NSD7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXFP3Q9NSD7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXFP3Q9NSD7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RXFP3Q9NSD7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXFP3Q9NSD7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXFP3Q9NSD7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXFP3Q9NSD7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXFP3Q9NSD7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RXFP3Q9NSD7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RXFP3Q9NSD7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RXFP3Q9NSD7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXFP3Q9NSD7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RXFP3Q9NSD7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RXFP3Q9NSD7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXFP3Q9NSD7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RXFP3Q9NSD7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RXFP3Q9NSD7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RXFP3Q9NSD7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RXFP3Q9NSD7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RXFP3Q9NSD7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RXFP3Q9NSD7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXFP3Q9NSD7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXFP3Q9NSD7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RXFP3Q9NSD7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms