Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF3Q9NR81 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF3Q9NR81 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF3Q9NR81 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF3Q9NR81 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF3Q9NR81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ARHGEF3Q9NR81 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARHGEF3Q9NR81 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF3Q9NR81 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF3Q9NR81 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARHGEF3Q9NR81 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF3Q9NR81 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ARHGEF3Q9NR81 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF3Q9NR81 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF3Q9NR81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3Q9NR81 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ARHGEF3Q9NR81 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF3Q9NR81 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF3Q9NR81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF3Q9NR81 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGEF3Q9NR81 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF3Q9NR81 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF3Q9NR81 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGEF3Q9NR81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF3Q9NR81 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGEF3Q9NR81 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGEF3Q9NR81 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGEF3Q9NR81 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
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