Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZCCHC17Q9NP64 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ZCCHC17Q9NP64 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZCCHC17Q9NP64 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ZCCHC17Q9NP64 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ZCCHC17Q9NP64 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZCCHC17Q9NP64 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZCCHC17Q9NP64 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZCCHC17Q9NP64 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZCCHC17Q9NP64 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZCCHC17Q9NP64 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZCCHC17Q9NP64 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZCCHC17Q9NP64 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZCCHC17Q9NP64 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZCCHC17Q9NP64 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZCCHC17Q9NP64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZCCHC17Q9NP64 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ZCCHC17Q9NP64 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZCCHC17Q9NP64 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZCCHC17Q9NP64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ZCCHC17Q9NP64 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZCCHC17Q9NP64 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZCCHC17Q9NP64 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZCCHC17Q9NP64 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ZCCHC17Q9NP64 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ZCCHC17Q9NP64 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZCCHC17Q9NP64 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZCCHC17Q9NP64 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZCCHC17Q9NP64 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZCCHC17Q9NP64 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZCCHC17Q9NP64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZCCHC17Q9NP64 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ZCCHC17Q9NP64 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZCCHC17Q9NP64 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZCCHC17Q9NP64 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZCCHC17Q9NP64 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZCCHC17Q9NP64 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZCCHC17Q9NP64 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZCCHC17Q9NP64 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZCCHC17Q9NP64 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZCCHC17Q9NP64 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZCCHC17Q9NP64 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZCCHC17Q9NP64 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms