Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASSF4Q9H2L5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RASSF4Q9H2L5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASSF4Q9H2L5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASSF4Q9H2L5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF4Q9H2L5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASSF4Q9H2L5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASSF4Q9H2L5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RASSF4Q9H2L5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RASSF4Q9H2L5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RASSF4Q9H2L5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF4Q9H2L5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF4Q9H2L5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF4Q9H2L5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RASSF4Q9H2L5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RASSF4Q9H2L5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RASSF4Q9H2L5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RASSF4Q9H2L5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RASSF4Q9H2L5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RASSF4Q9H2L5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RASSF4Q9H2L5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF4Q9H2L5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RASSF4Q9H2L5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASSF4Q9H2L5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASSF4Q9H2L5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASSF4Q9H2L5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASSF4Q9H2L5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASSF4Q9H2L5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASSF4Q9H2L5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASSF4Q9H2L5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASSF4Q9H2L5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASSF4Q9H2L5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RASSF4Q9H2L5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASSF4Q9H2L5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASSF4Q9H2L5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASSF4Q9H2L5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms