Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
COL25A1Q9BXS0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
COL25A1Q9BXS0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
COL25A1Q9BXS0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
COL25A1Q9BXS0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
COL25A1Q9BXS0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL25A1Q9BXS0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL25A1Q9BXS0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL25A1Q9BXS0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
COL25A1Q9BXS0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL25A1Q9BXS0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
COL25A1Q9BXS0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL25A1Q9BXS0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL25A1Q9BXS0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL25A1Q9BXS0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL25A1Q9BXS0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL25A1Q9BXS0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL25A1Q9BXS0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL25A1Q9BXS0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL25A1Q9BXS0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
COL25A1Q9BXS0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL25A1Q9BXS0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL25A1Q9BXS0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL25A1Q9BXS0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL25A1Q9BXS0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL25A1Q9BXS0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL25A1Q9BXS0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL25A1Q9BXS0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL25A1Q9BXS0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL25A1Q9BXS0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
COL25A1Q9BXS0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL25A1Q9BXS0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL25A1Q9BXS0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL25A1Q9BXS0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL25A1Q9BXS0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL25A1Q9BXS0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL25A1Q9BXS0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL25A1Q9BXS0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL25A1Q9BXS0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL25A1Q9BXS0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL25A1Q9BXS0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL25A1Q9BXS0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL25A1Q9BXS0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL25A1Q9BXS0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL25A1Q9BXS0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL25A1Q9BXS0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL25A1Q9BXS0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL25A1Q9BXS0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL25A1Q9BXS0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL25A1Q9BXS0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL25A1Q9BXS0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL25A1Q9BXS0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL25A1Q9BXS0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL25A1Q9BXS0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
COL25A1Q9BXS0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL25A1Q9BXS0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COL25A1Q9BXS0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL25A1Q9BXS0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL25A1Q9BXS0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL25A1Q9BXS0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
COL25A1Q9BXS0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL25A1Q9BXS0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL25A1Q9BXS0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL25A1Q9BXS0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL25A1Q9BXS0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL25A1Q9BXS0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL25A1Q9BXS0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL25A1Q9BXS0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL25A1Q9BXS0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL25A1Q9BXS0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL25A1Q9BXS0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL25A1Q9BXS0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL25A1Q9BXS0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL25A1Q9BXS0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
COL25A1Q9BXS0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL25A1Q9BXS0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL25A1Q9BXS0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL25A1Q9BXS0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
COL25A1Q9BXS0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
COL25A1Q9BXS0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL25A1Q9BXS0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL25A1Q9BXS0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL25A1Q9BXS0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL25A1Q9BXS0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL25A1Q9BXS0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL25A1Q9BXS0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL25A1Q9BXS0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL25A1Q9BXS0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL25A1Q9BXS0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL25A1Q9BXS0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms