Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D3Q9BRN9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM2D3Q9BRN9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM2D3Q9BRN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM2D3Q9BRN9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM2D3Q9BRN9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM2D3Q9BRN9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D3Q9BRN9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM2D3Q9BRN9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM2D3Q9BRN9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TM2D3Q9BRN9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM2D3Q9BRN9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM2D3Q9BRN9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TM2D3Q9BRN9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM2D3Q9BRN9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TM2D3Q9BRN9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D3Q9BRN9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM2D3Q9BRN9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM2D3Q9BRN9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM2D3Q9BRN9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM2D3Q9BRN9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms