Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS25Q9BRG1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS25Q9BRG1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS25Q9BRG1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS25Q9BRG1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms