Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USB1Q9BQ65 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USB1Q9BQ65 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USB1Q9BQ65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USB1Q9BQ65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USB1Q9BQ65 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USB1Q9BQ65 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USB1Q9BQ65 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USB1Q9BQ65 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USB1Q9BQ65 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USB1Q9BQ65 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USB1Q9BQ65 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USB1Q9BQ65 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USB1Q9BQ65 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USB1Q9BQ65 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms