Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
JMJD8Q96S16 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JMJD8Q96S16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JMJD8Q96S16 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
JMJD8Q96S16 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JMJD8Q96S16 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
JMJD8Q96S16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JMJD8Q96S16 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JMJD8Q96S16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
JMJD8Q96S16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JMJD8Q96S16 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JMJD8Q96S16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JMJD8Q96S16 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JMJD8Q96S16 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JMJD8Q96S16 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
JMJD8Q96S16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
JMJD8Q96S16 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
JMJD8Q96S16 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JMJD8Q96S16 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JMJD8Q96S16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JMJD8Q96S16 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
JMJD8Q96S16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
JMJD8Q96S16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JMJD8Q96S16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JMJD8Q96S16 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JMJD8Q96S16 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JMJD8Q96S16 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JMJD8Q96S16 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
JMJD8Q96S16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
JMJD8Q96S16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
JMJD8Q96S16 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JMJD8Q96S16 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
JMJD8Q96S16 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD8Q96S16 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms