Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF12Q96QT6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHF12Q96QT6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF12Q96QT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHF12Q96QT6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHF12Q96QT6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF12Q96QT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHF12Q96QT6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHF12Q96QT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF12Q96QT6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF12Q96QT6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF12Q96QT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHF12Q96QT6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHF12Q96QT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF12Q96QT6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms