Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK1Q96QP1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALPK1Q96QP1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK1Q96QP1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK1Q96QP1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ALPK1Q96QP1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK1Q96QP1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALPK1Q96QP1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALPK1Q96QP1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALPK1Q96QP1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALPK1Q96QP1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALPK1Q96QP1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALPK1Q96QP1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALPK1Q96QP1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALPK1Q96QP1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALPK1Q96QP1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALPK1Q96QP1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK1Q96QP1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK1Q96QP1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK1Q96QP1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK1Q96QP1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK1Q96QP1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK1Q96QP1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK1Q96QP1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALPK1Q96QP1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALPK1Q96QP1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK1Q96QP1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALPK1Q96QP1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALPK1Q96QP1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK1Q96QP1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALPK1Q96QP1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK1Q96QP1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms