Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00052Q96N35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00052Q96N35 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00052Q96N35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00052Q96N35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00052Q96N35 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00052Q96N35 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00052Q96N35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00052Q96N35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00052Q96N35 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00052Q96N35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00052Q96N35 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00052Q96N35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00052Q96N35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00052Q96N35 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00052Q96N35 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00052Q96N35 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00052Q96N35 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00052Q96N35 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00052Q96N35 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00052Q96N35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00052Q96N35 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00052Q96N35 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00052Q96N35 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00052Q96N35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00052Q96N35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00052Q96N35 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00052Q96N35 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00052Q96N35 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00052Q96N35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00052Q96N35 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00052Q96N35 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms