Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC46Q96FV0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC46Q96FV0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC46Q96FV0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC46Q96FV0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC46Q96FV0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC46Q96FV0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC46Q96FV0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC46Q96FV0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC46Q96FV0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC46Q96FV0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC46Q96FV0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC46Q96FV0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC46Q96FV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC46Q96FV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC46Q96FV0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms