Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SREK1Q8WXA9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SREK1Q8WXA9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREK1Q8WXA9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREK1Q8WXA9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SREK1Q8WXA9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SREK1Q8WXA9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SREK1Q8WXA9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SREK1Q8WXA9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SREK1Q8WXA9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SREK1Q8WXA9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SREK1Q8WXA9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SREK1Q8WXA9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SREK1Q8WXA9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SREK1Q8WXA9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SREK1Q8WXA9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREK1Q8WXA9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SREK1Q8WXA9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREK1Q8WXA9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREK1Q8WXA9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SREK1Q8WXA9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SREK1Q8WXA9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SREK1Q8WXA9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREK1Q8WXA9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREK1Q8WXA9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREK1Q8WXA9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SREK1Q8WXA9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREK1Q8WXA9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREK1Q8WXA9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SREK1Q8WXA9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREK1Q8WXA9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SREK1Q8WXA9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SREK1Q8WXA9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SREK1Q8WXA9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREK1Q8WXA9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREK1Q8WXA9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREK1Q8WXA9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SREK1Q8WXA9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SREK1Q8WXA9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 341 ms