Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2Z9

CENPS, Centromere protein S, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPSQ8N2Z9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPSQ8N2Z9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPSQ8N2Z9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPSQ8N2Z9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPSQ8N2Z9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPSQ8N2Z9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPSQ8N2Z9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPSQ8N2Z9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPSQ8N2Z9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPSQ8N2Z9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPSQ8N2Z9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPSQ8N2Z9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPSQ8N2Z9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPSQ8N2Z9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPSQ8N2Z9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPSQ8N2Z9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPSQ8N2Z9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPSQ8N2Z9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPSQ8N2Z9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPSQ8N2Z9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPSQ8N2Z9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPSQ8N2Z9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPSQ8N2Z9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms