Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00518Q8N0U6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00518Q8N0U6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00518Q8N0U6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00518Q8N0U6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00518Q8N0U6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00518Q8N0U6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00518Q8N0U6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00518Q8N0U6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00518Q8N0U6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00518Q8N0U6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00518Q8N0U6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00518Q8N0U6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00518Q8N0U6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00518Q8N0U6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms