Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC6BQ86SZ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms