Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
PREX2Q70Z35 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PREX2Q70Z35 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
PREX2Q70Z35 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
PREX2Q70Z35 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
PREX2Q70Z35 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
PREX2Q70Z35 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PREX2Q70Z35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PREX2Q70Z35 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
PREX2Q70Z35 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
PREX2Q70Z35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PREX2Q70Z35 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
PREX2Q70Z35 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
PREX2Q70Z35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
PREX2Q70Z35 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
PREX2Q70Z35 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.12■■■■■ 4.49
PREX2Q70Z35 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PREX2Q70Z35 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
PREX2Q70Z35 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
PREX2Q70Z35 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PREX2Q70Z35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PREX2Q70Z35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PREX2Q70Z35 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
PREX2Q70Z35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
PREX2Q70Z35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PREX2Q70Z35 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
PREX2Q70Z35 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
PREX2Q70Z35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
PREX2Q70Z35 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
PREX2Q70Z35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
PREX2Q70Z35 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PREX2Q70Z35 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
PREX2Q70Z35 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PREX2Q70Z35 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
PREX2Q70Z35 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
PREX2Q70Z35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
PREX2Q70Z35 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
PREX2Q70Z35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PREX2Q70Z35 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
PREX2Q70Z35 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
PREX2Q70Z35 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
PREX2Q70Z35 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
PREX2Q70Z35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
PREX2Q70Z35 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
PREX2Q70Z35 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PREX2Q70Z35 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PREX2Q70Z35 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
PREX2Q70Z35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PREX2Q70Z35 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
PREX2Q70Z35 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PREX2Q70Z35 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PREX2Q70Z35 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PREX2Q70Z35 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
PREX2Q70Z35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PREX2Q70Z35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PREX2Q70Z35 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
PREX2Q70Z35 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
PREX2Q70Z35 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PREX2Q70Z35 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PREX2Q70Z35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PREX2Q70Z35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PREX2Q70Z35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PREX2Q70Z35 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PREX2Q70Z35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PREX2Q70Z35 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PREX2Q70Z35 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
PREX2Q70Z35 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
PREX2Q70Z35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PREX2Q70Z35 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
PREX2Q70Z35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
PREX2Q70Z35 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
PREX2Q70Z35 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
PREX2Q70Z35 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
PREX2Q70Z35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
PREX2Q70Z35 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
PREX2Q70Z35 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
PREX2Q70Z35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PREX2Q70Z35 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PREX2Q70Z35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms