Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNI2Q6ZMN8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNI2Q6ZMN8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNI2Q6ZMN8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNI2Q6ZMN8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNI2Q6ZMN8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCNI2Q6ZMN8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCNI2Q6ZMN8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCNI2Q6ZMN8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCNI2Q6ZMN8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNI2Q6ZMN8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNI2Q6ZMN8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNI2Q6ZMN8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNI2Q6ZMN8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNI2Q6ZMN8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNI2Q6ZMN8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNI2Q6ZMN8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCNI2Q6ZMN8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNI2Q6ZMN8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNI2Q6ZMN8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNI2Q6ZMN8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNI2Q6ZMN8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNI2Q6ZMN8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNI2Q6ZMN8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNI2Q6ZMN8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNI2Q6ZMN8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNI2Q6ZMN8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCNI2Q6ZMN8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNI2Q6ZMN8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNI2Q6ZMN8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNI2Q6ZMN8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNI2Q6ZMN8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNI2Q6ZMN8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNI2Q6ZMN8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNI2Q6ZMN8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNI2Q6ZMN8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNI2Q6ZMN8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNI2Q6ZMN8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNI2Q6ZMN8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms