Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC181Q5TID7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC181Q5TID7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC181Q5TID7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC181Q5TID7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC181Q5TID7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC181Q5TID7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC181Q5TID7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms