Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL8

PDZD11, PDZ domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD11Q5EBL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZD11Q5EBL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZD11Q5EBL8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDZD11Q5EBL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZD11Q5EBL8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZD11Q5EBL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDZD11Q5EBL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZD11Q5EBL8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD11Q5EBL8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD11Q5EBL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDZD11Q5EBL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDZD11Q5EBL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDZD11Q5EBL8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDZD11Q5EBL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDZD11Q5EBL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDZD11Q5EBL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD11Q5EBL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD11Q5EBL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDZD11Q5EBL8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZD11Q5EBL8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDZD11Q5EBL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms