Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A4Q53GD3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC44A4Q53GD3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC44A4Q53GD3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC44A4Q53GD3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC44A4Q53GD3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC44A4Q53GD3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC44A4Q53GD3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC44A4Q53GD3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC44A4Q53GD3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC44A4Q53GD3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC44A4Q53GD3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC44A4Q53GD3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC44A4Q53GD3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC44A4Q53GD3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC44A4Q53GD3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC44A4Q53GD3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC44A4Q53GD3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC44A4Q53GD3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC44A4Q53GD3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC44A4Q53GD3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC44A4Q53GD3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC44A4Q53GD3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC44A4Q53GD3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC44A4Q53GD3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC44A4Q53GD3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A4Q53GD3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC44A4Q53GD3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC44A4Q53GD3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A4Q53GD3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC44A4Q53GD3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC44A4Q53GD3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC44A4Q53GD3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms