Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf17Q53FE4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf17Q53FE4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4orf17Q53FE4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf17Q53FE4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf17Q53FE4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf17Q53FE4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf17Q53FE4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf17Q53FE4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf17Q53FE4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf17Q53FE4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4orf17Q53FE4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4orf17Q53FE4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4orf17Q53FE4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4orf17Q53FE4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4orf17Q53FE4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C4orf17Q53FE4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C4orf17Q53FE4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4orf17Q53FE4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C4orf17Q53FE4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4orf17Q53FE4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4orf17Q53FE4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4orf17Q53FE4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C4orf17Q53FE4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C4orf17Q53FE4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4orf17Q53FE4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4orf17Q53FE4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4orf17Q53FE4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4orf17Q53FE4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4orf17Q53FE4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf17Q53FE4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf17Q53FE4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C4orf17Q53FE4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C4orf17Q53FE4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C4orf17Q53FE4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C4orf17Q53FE4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C4orf17Q53FE4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C4orf17Q53FE4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4orf17Q53FE4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4orf17Q53FE4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C4orf17Q53FE4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4orf17Q53FE4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4orf17Q53FE4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4orf17Q53FE4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C4orf17Q53FE4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms