Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2CD3Q4AC94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2CD3Q4AC94 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2CD3Q4AC94 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2CD3Q4AC94 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C2CD3Q4AC94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C2CD3Q4AC94 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2CD3Q4AC94 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2CD3Q4AC94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2CD3Q4AC94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C2CD3Q4AC94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2CD3Q4AC94 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C2CD3Q4AC94 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2CD3Q4AC94 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2CD3Q4AC94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C2CD3Q4AC94 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C2CD3Q4AC94 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2CD3Q4AC94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2CD3Q4AC94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2CD3Q4AC94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2CD3Q4AC94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2CD3Q4AC94 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2CD3Q4AC94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2CD3Q4AC94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2CD3Q4AC94 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2CD3Q4AC94 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2CD3Q4AC94 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD3Q4AC94 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2CD3Q4AC94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD3Q4AC94 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD3Q4AC94 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD3Q4AC94 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD3Q4AC94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2CD3Q4AC94 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C2CD3Q4AC94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2CD3Q4AC94 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD3Q4AC94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C2CD3Q4AC94 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2CD3Q4AC94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2CD3Q4AC94 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C2CD3Q4AC94 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2CD3Q4AC94 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2CD3Q4AC94 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2CD3Q4AC94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2CD3Q4AC94 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD3Q4AC94 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2CD3Q4AC94 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD3Q4AC94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD3Q4AC94 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2CD3Q4AC94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms