Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
FHOD3Q2V2M9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
FHOD3Q2V2M9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
FHOD3Q2V2M9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
FHOD3Q2V2M9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
FHOD3Q2V2M9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
FHOD3Q2V2M9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
FHOD3Q2V2M9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
FHOD3Q2V2M9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
FHOD3Q2V2M9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
FHOD3Q2V2M9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
FHOD3Q2V2M9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
FHOD3Q2V2M9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
FHOD3Q2V2M9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
FHOD3Q2V2M9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
FHOD3Q2V2M9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
FHOD3Q2V2M9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
FHOD3Q2V2M9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
FHOD3Q2V2M9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
FHOD3Q2V2M9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
FHOD3Q2V2M9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
FHOD3Q2V2M9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
FHOD3Q2V2M9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
FHOD3Q2V2M9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
FHOD3Q2V2M9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
FHOD3Q2V2M9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
FHOD3Q2V2M9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
FHOD3Q2V2M9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
FHOD3Q2V2M9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
FHOD3Q2V2M9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
FHOD3Q2V2M9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
FHOD3Q2V2M9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
FHOD3Q2V2M9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.72
FHOD3Q2V2M9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.54■■■■■ 4.72
FHOD3Q2V2M9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
FHOD3Q2V2M9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
FHOD3Q2V2M9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
FHOD3Q2V2M9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
FHOD3Q2V2M9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
FHOD3Q2V2M9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
FHOD3Q2V2M9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
FHOD3Q2V2M9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
FHOD3Q2V2M9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.41■■■■■ 4.7
FHOD3Q2V2M9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
FHOD3Q2V2M9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
FHOD3Q2V2M9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
FHOD3Q2V2M9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
FHOD3Q2V2M9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
FHOD3Q2V2M9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
FHOD3Q2V2M9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
FHOD3Q2V2M9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
FHOD3Q2V2M9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
FHOD3Q2V2M9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
FHOD3Q2V2M9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
FHOD3Q2V2M9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
FHOD3Q2V2M9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
FHOD3Q2V2M9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
FHOD3Q2V2M9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
FHOD3Q2V2M9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
FHOD3Q2V2M9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
FHOD3Q2V2M9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
FHOD3Q2V2M9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
FHOD3Q2V2M9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
FHOD3Q2V2M9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.64
FHOD3Q2V2M9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
FHOD3Q2V2M9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
FHOD3Q2V2M9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
FHOD3Q2V2M9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
FHOD3Q2V2M9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
FHOD3Q2V2M9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
FHOD3Q2V2M9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
FHOD3Q2V2M9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
FHOD3Q2V2M9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
FHOD3Q2V2M9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
FHOD3Q2V2M9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
FHOD3Q2V2M9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
FHOD3Q2V2M9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
FHOD3Q2V2M9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
FHOD3Q2V2M9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
FHOD3Q2V2M9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
FHOD3Q2V2M9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
FHOD3Q2V2M9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
FHOD3Q2V2M9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.86■■■■■ 4.61
FHOD3Q2V2M9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
FHOD3Q2V2M9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
FHOD3Q2V2M9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
FHOD3Q2V2M9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
FHOD3Q2V2M9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
FHOD3Q2V2M9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
FHOD3Q2V2M9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms