Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TXNRD1Q16881 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TXNRD1Q16881 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TXNRD1Q16881 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TXNRD1Q16881 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TXNRD1Q16881 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TXNRD1Q16881 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TXNRD1Q16881 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TXNRD1Q16881 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TXNRD1Q16881 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TXNRD1Q16881 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TXNRD1Q16881 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TXNRD1Q16881 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TXNRD1Q16881 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TXNRD1Q16881 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TXNRD1Q16881 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TXNRD1Q16881 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TXNRD1Q16881 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
TXNRD1Q16881 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TXNRD1Q16881 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TXNRD1Q16881 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TXNRD1Q16881 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TXNRD1Q16881 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TXNRD1Q16881 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TXNRD1Q16881 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TXNRD1Q16881 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TXNRD1Q16881 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TXNRD1Q16881 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TXNRD1Q16881 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TXNRD1Q16881 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TXNRD1Q16881 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TXNRD1Q16881 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
TXNRD1Q16881 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
TXNRD1Q16881 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TXNRD1Q16881 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TXNRD1Q16881 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TXNRD1Q16881 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TXNRD1Q16881 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TXNRD1Q16881 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TXNRD1Q16881 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TXNRD1Q16881 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TXNRD1Q16881 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TXNRD1Q16881 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TXNRD1Q16881 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TXNRD1Q16881 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TXNRD1Q16881 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TXNRD1Q16881 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TXNRD1Q16881 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNRD1Q16881 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TXNRD1Q16881 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TXNRD1Q16881 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TXNRD1Q16881 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TXNRD1Q16881 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TXNRD1Q16881 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TXNRD1Q16881 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TXNRD1Q16881 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TXNRD1Q16881 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TXNRD1Q16881 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TXNRD1Q16881 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TXNRD1Q16881 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TXNRD1Q16881 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TXNRD1Q16881 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TXNRD1Q16881 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TXNRD1Q16881 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TXNRD1Q16881 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TXNRD1Q16881 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TXNRD1Q16881 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNRD1Q16881 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNRD1Q16881 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TXNRD1Q16881 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TXNRD1Q16881 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TXNRD1Q16881 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
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